Normal yolların dışında GPU'ların bu şekilde kullanılabilmesi ne kadar ilgi çekici olsa da, eklememiz gereken ufak birkaç not var. Tabii ki GPU'ların geleneksel bilgisayarların yerini alması beklenemez. Süper bilgisayarlar yüksek kapasitede bellek taşıyabilirler ve genelde boyut olarak Terabyte'ları bulduklarından bugünün GPU'larıyla karşılaştırılması imkan dahilinde değil. Süper bilgisayarlar ve GPU'lar üzerinde çalışan bilim adamlarıyla konuştuğumuzda, onların genellikle şuna inandıklarına şahit oluyoruz: Süper bilgisayarlar tam olarak GPU'lara geçişi sağlamayacak, ancak bu sistemleri geleneksel bilgisayarlara göre daha fazla geliştirebilecek.

Bu sistemin bir diğer ilgi çeken parçası ise anakartı. Dikkat edilirse MSI K9A2 Platinum aslında Nvidia SLI destekli bir kart değil, ancak AMD Crossfire'ı (780 çipset) kullanıyor. Bu basit nedenden ötürü bu kartı seçmek maliyetli olabilir, ancak sistemin performansına beklenmedik bir etkisi de olabilir. CUDA, bu kez SLI'yi desteklemiyor. Bunun anlamı GPU'ların PCI Express aracılığıyla CPU ile birbirlerinin arasında iletişim kurması gerektiği. Araştırmacılar, bu durumun performans üzerinde herhangi bir etki görmediklerini savunurken, GPU'ların daha iyi bir tablo çizdiğini dile getirmekten de geri kalmıyor.